อินฟันตามารีอา ฟรังซิชกาแห่งโปรตุเกส ดัชเชสแห่งกูอิงบรา ประสูติเมื่อวันที่ 3 มีนาคม พ.ศ. 2540 เป็นพระธิดาพระองค์ที่ 2 และพระองค์เดียวใน เจ้าชายดูอาร์ท ปิโอ ดยุกแห่งบรากันซา และเจ้าหญิงอีซาแบล ดัชเชสแห่งบรากังซา ถึงแม้พระองค์จะเป็นพระบุตรพระองค์ที่ 2 และทรงเป็นผู้อ้างสิทธิ์ราชบัลลังก์ลำดับที่ 3 ต่อจากพระเชษฐาและพระอนุชาเนื่องจากกฎหมายให้สิทธิบุรุษมาก่อนสตรี ทรงพระบิดาทูลหัวคือ อินฟันเตเฮนริเก ดยุกแห่งกูอิงบรา กับ เจ้าหญิงมารีแห่งลิกเตนสไตน์ (ประสูติ พ.ศ. 2502)

พระองค์ทรงได้รับการสถาปนาเป็น ดัชเชสแห่งกูอิงบรา ภายหลังการสิ้นพระชนม์ของ อินฟันเตเฮนริเก ดยุกแห่งกูอิงบรา พระปิตุลา (อา)ของพระองค์ เมื่อปี 2560